Última revisión: 4 de septiembre de 2026. Excepciones a la
obligación de expedir factura del artículo 3 del RD 1619/2012 y exenciones sanitarias del artículo
20.Uno de la Ley del IVA contrastadas en el BOE; ámbito en el RD 1007/2023; calendario en el
RD-ley 15/2025.
Estar exento de IVA no te deja fuera de Verifactu. Es la confusión más extendida
en las consultas de fisioterapia, psicología, logopedia, podología, nutrición clínica y enfermería:
como no se repercute IVA, mucha gente asume que tampoco hay obligación de facturar. La hay. Y por
tanto, si emites esas facturas con un programa, entras. Tu fecha es el 1 de julio de
2027 si ejerces como autónomo y el 1 de enero de 2027 si la consulta es
una sociedad.
La razón está en una lista de dos líneas del Reglamento de facturación, y merece la pena verla
literalmente porque es lo que zanja la discusión con cualquier compañero de gremio.
La lista que os deja dentro
El artículo 3.1.a) del
RD 1619/2012 establece que no hay obligación de expedir factura en las
operaciones exentas del artículo 20.Uno de la Ley del IVA… y a renglón seguido excepciona una lista
tasada de números en los que la factura sí es obligatoria. En esa lista figuran
los números 2.º (hospitalización y asistencia sanitaria por entidades de derecho
público o establecimientos privados en régimen de precios autorizados) y 3.º
(asistencia a personas físicas por profesionales médicos y sanitarios).
Traducido a tu consulta: la sesión de fisioterapia está exenta de IVA por el 20.Uno.3.º, pero
tienes que documentarla en factura. Y una factura emitida con un sistema informático genera
registro de facturación encadenado desde tu fecha, con su huella y su código QR
(qué es el registro de alta).
Compáralo con la enseñanza: las exenciones educativas de los números 9.º y 10.º no están en esa
lista, y por eso una academia puede quedar materialmente fuera
(su caso). La sanidad no tiene esa salida.
Quién está exento y quién no dentro de tu propia consulta
| Servicio | IVA | ¿Factura obligatoria? | ¿Entra en Verifactu? |
|---|---|---|---|
| Sesión de fisioterapia con finalidad de diagnóstico, prevención o tratamiento | Exenta (20.Uno.3.º) | Sí | Sí |
| Terapia psicológica por psicólogo sanitario | Exenta (20.Uno.3.º) | Sí | Sí |
| Coaching, mentoring, formación o intervención en RR. HH. | Sujeto, 21 % | Sí | Sí |
| Peritaje o informe psicológico forense a instancia de un juzgado o aseguradora | Habitualmente sujeto: finalidad no terapéutica | Sí | Sí |
| Masaje de relajación o estético sin finalidad terapéutica | Sujeto, 21 % | Sí (o simplificada) | Sí |
| Venta de productos: fajas, plantillas, material ortopédico, suplementos | Sujeto | Sí (o simplificada) | Sí |
| Alquiler de box o sala a otro profesional | Sujeto, 21 % | Sí | Sí |
| Facturación a mutua, aseguradora o empresa | Según el servicio | Sí, factura completa | Sí |
No hay ninguna fila con «no» en la última columna. Esa es la conclusión práctica del sector: en
una consulta sanitaria, todo lo que se cobra acaba documentado en factura, exenta o no, y por tanto
todo pasa por el sistema.
Actividad mixta: el punto que más problemas dará
Muchas consultas combinan servicios exentos y sujetos. Eso obliga a que el programa sepa hacer
tres cosas que no todos los gestores de citas hacen hoy:
- Emitir facturas exentas con mención expresa del precepto aplicable —el
artículo 20.Uno.3.º— tal como exige el artículo 6.1.j) del Reglamento de facturación. - Emitir facturas con IVA repercutido en la misma serie o en serie propia, sin romper la
correlatividad. - Registrar correctamente la clave de operación exenta en el registro de
facturación, según las especificaciones de la
Orden HAC/1177/2024.
Si tu software de gestión de pacientes emite hoy un PDF sin mención de exención o con un IVA al
0 % genérico, esa es la conversación que tienes que tener con tu proveedor antes de 2027.
Datos de salud y protección de datos: dos normas que no se solapan
La duda que más se repite en las consultas: si el registro se remite a la Agencia Tributaria,
¿se envía información clínica de mis pacientes? No. El registro de facturación contiene los datos
propios de la factura —identificación del emisor, del destinatario cuando proceda, número, fecha,
descripción de la operación, importes y desglose—, no la historia clínica.
La consecuencia práctica va en el otro sentido: la descripción de la operación
que teclees en la factura sí viaja. Es una razón excelente para escribir «sesión de fisioterapia» o
«tratamiento psicológico» y no un diagnóstico. Es un cambio de hábito barato y evita un problema de
minimización de datos.
[VERIFICAR: no consta pronunciamiento específico de la AEPD sobre el
contenido de los registros de facturación de profesionales sanitarios remitidos a la AEAT en el
marco del RRSIF.]
La factura simplificada en consulta
Puedes usar factura simplificada por debajo de 400 € con carácter general. El
límite de 3.000 € que circula por foros solo se aplica a la lista tasada del artículo 4.2 del
RD 1619/2012 —hostelería, peluquería, transporte de personas, venta al por menor y similares—, en
la que la asistencia sanitaria no está. Con tickets medios de consulta el límite general te sobra,
pero tu paciente necesitará factura completa con su NIF en cuanto quiera
deducírsela o presentarla a su seguro o a la mutua. Ver
factura simplificada y tickets.
Y cuando ocurra después de haber emitido el ticket: no se borra ni se sustituye. Se emite la
factura que proceda y se rectifica lo ya emitido, en serie separada, manteniendo la numeración
original (anular una factura).
Preguntas frecuentes
Estoy exento de IVA y no presento el modelo 303. ¿Aun así entro?
Sí. La obligación de Verifactu no cuelga de si presentas IVA, sino de si expides facturas con un
sistema informático. La consulta médica es el ejemplo de manual de exento obligado a facturar.
Trabajo en una clínica ajena y ellos facturan al paciente.
Entonces la clínica es el obligado por esas operaciones, y tú emites tu factura de honorarios a
la clínica: esa es tuya y también entra. Si es la clínica quien te emite la factura a ti, revisa
facturación por el destinatario.
Uso un software de gestión de pacientes con agenda y facturación integrada.
Ese es tu sistema informático de facturación. Pídele al fabricante la declaración responsable del
artículo 13 del RD 1007/2023: cómo
pedirla. Nadie puede venderte un programa «homologado»
(por qué no existe).
¿Y si facturo desde una hoja de cálculo con mi plantilla de siempre?
Deja de valer: Excel y Word con Verifactu.
Soy psicólogo no sanitario y hago selección de personal.
Entonces tus servicios no encajan en la exención del 20.Uno.3.º y facturas con IVA al 21 %. En
Verifactu estás igual de dentro, solo cambia el desglose.
¿Existe alguna forma de que me excluyan por el tipo de actividad?
Solo la vía excepcional del artículo 5 del RD 1007/2023, que se resuelve por sectores o por
circunstancias técnicas y es muy poco frecuente:
la resolución de no aplicación.
Siguiente paso: confirma tu fecha en
¿estoy obligado a Verifactu?, pasa tu software de
consulta por el comprobador de requisitos y
repasa el panorama del sector en
Verifactu en consultas médicas y actividades sanitarias
exentas.
Guía divulgativa e independiente, sin vinculación con la Agencia Tributaria. El
alcance de la exención sanitaria depende de la titulación, de la finalidad terapéutica del servicio
y del tipo de centro: contrástalo con tu asesor fiscal.